Tips:

# 仅供 IEMB-1 用户参考。

# 进入登陆服务器页面后,所有命令可直接使用复制粘贴使用。

1. 对组装基因组进行Quast评估及端粒统计

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cd /your assembly path/

# 以端粒结构为CCCCAAAA的串联重复为例
# 运行脚本
/apps/users/andrew/littletools/assembly_telomere_stat.sh yourassembly.fasta CCCCAAAA TTTTGGGG

# 获得`telomere_stat.XX.txt`文件,包含基因组端粒统计结果及Quast统计结果